毛细色谱柱柱内有三个涂层：管身外壁的聚酰亚胺涂层可以防止色谱柱断裂，并使色谱柱外表呈深琥珀色；中间是熔融石英骨架；涂于管身内壁的固定液膜（即固定相）起到分离混合样品组分的功能，其种类多种多样。
毛细色谱柱出现破损现象，是什么原因造成的：
通常毛细管柱内涂渍一层聚合体固定相，如聚硅氧烷类、聚乙二醇类等，在它的外面常涂有一层聚酰亚胺涂层。聚酰亚胺涂层具有较好的强度和耐热性，但特殊高温条件下，聚酰亚胺涂层经受不住高温老化，所以近年来出现了镀铝层弹性石英毛细管柱。涂有聚酰亚胺涂层的石英毛细管柱只要保存在惰性环境中，其本身就固有较高的抗张强度。但它对潮湿水分比较敏感，一旦柱子外侧聚酰亚胺保护层破损，这就为水分的进入提供通道，从而导致石英柱的断裂。
错误处置的毛细柱也会在柱子表面留下不经意的擦痕。这些擦痕与水分接触并不断蔓延，经过一段时间最终导致柱子断裂。如果在高温运作时发生柱子断裂，那么柱子通常由于接触空气而受到破坏。
毛细色谱柱安装前的检查：
1、检查气瓶压力以确保有足够的载气、尾吹气和燃气。载气的纯度不低于99.995%。
2、清洁进样口，必要时更换进样口密封垫圈，进样口衬管和隔垫。
3、检査检测器密封垫圈，必要时更换。如有必要，清洗或更换检测器喷嘴。
4、仔细检查柱子是否有破损或断裂。
